Para realizar el diagnóstico de trastorno del espectro autista no es suficiente ir «palomeando» los criterios del DSM-5-TR para esta categoría. Es necesario hacer una historia clínica completa y detallada, interrogando los antecedentes perinatales del niño así como la presencia de trastornos del neurodesarrollo en otros miembros de la familia. Se debe de tomar en cuenta también el grado de desarrollo (motor, del lenguaje, socialización) que tiene el paciente y el nivel de funcionamiento que ha alcanzado con respecto a otros niños de su edad. Todo esto aunado a la observación del paciente en el consultorio (y en la sala de espera) prestando particular atención a las preocupaciones que expresan los padres y maestros sobre la conducta del niño en diferentes ámbitos. 

También hay que tomar en cuenta las opiniones y diagnósticos realizados por otros profesionales (por ej. neuropediatras, foniatras, paidopsiquiatras, psicólogos, terapeutas) en el pasado y la respuesta que el paciente tuvo a los tratamientos prescritos. 

Por si fuera poco, no hay que olvidar que el diagnóstico se puede replantear en cada consulta. No es raro que muchos niños que recibieron el diagnóstico de autismo cuando eran muy pequeños, más adelante expresen los síntomas del trastorno por déficit de atención con hiperactividad.